装订与装盒
装订：对于纸张较小或零散的文件，可采用装订机装订或线装的方式，使其成为一个整体，防止文件丢失。
装盒：将装订好的档案或单份档案装入档案盒，并在档案盒上标注档号、题名、年度等信息，便于存放和查找。
按时间顺序整理
年度分类法：将档案按其形成的年度进行分类，能清晰展现档案形成的时间脉络，体现不同年度工作的连续性和发展变化。例如，一个企业每年都会产生财务报表、工作总结、业务合同等档案，按年度分类后，可直观了解企业在不同年份的经营状况和业务发展情况。
阶段分类法：对于一些大型项目或长期工作，可以根据其进展阶段来整理档案。比如，一个建设项目可分为规划设计、施工建设、竣工验收等阶段，将各阶段相关的文件、图纸、报告等分别整理在一起，能完整呈现项目的全过程。
按内容主题分类
问题分类法：依据档案所反映的主题内容进行分类，将同一问题或同一专题的档案集中整理。例如，企业关于产品研发的档案，可将涉及不同产品研发的市场调研、技术方案、实验数据等归为一类，便于集中查阅和研究相关问题。
事由分类法：按照档案所涉及的具体事件或事务进行分类。如在处理法律纠纷时，将与该纠纷相关的合同、往来信件、庭审记录等档案整理在一起，能呈现事件的起因、经过和结果。
按文件间的关联分类
系列文件分类：对于具有连续性、关联性的系列文件，如会议文件，可将会议通知、议程、报告、决议等按会议的先后顺序整理成一个系列，体现会议的完整过程和决策形成的脉络。
文件组合分类：将在内容上相互补充、相互印证的文件组合在一起。例如，一份政策文件与其相关的实施细则、解释说明、执行情况报告等组合分类，能更、深入地反映政策的制定和执行情况。